Entre los principales desafíos que comprenden a este proceso se pueden encontrar:

1. Definir en la estrategia el tipo de solicitud (interna o externa) que sea más efectivo y eficaz para el organismo. En muchas ocasiones estamos convencidos de que los proveedores ejecutarían un mejor trabajo que nuestras áreas de tecnología y eso tal vez no sea del todo cierto. Otras veces estamos convencidos de que nuestras áreas de tecnologías son las mejores y tal vez eso tampoco sea del todo cierto.
2. Asegurar que los productos de trabajos estén completos.
3. Desarrollar capacidades dentro del equipo de trabajo.
4. Conseguir la disponibilidad financiera necesaria para la ejecución del proyecto.
5. Planificar la distribución de los recursos de disponibilidad financiera para la ejecución del proyecto de forma acertada.
6. Construir canales de comunicación formales.
7. Conocer proveedores de software calificados que aseguren la construcción de sistemas de gran calidad.
8. Mantener los procesos de desarrollo de software bajo control donde intervienen provisiones o servicios de terceros.